|
Výzkum - Biotechnologie
|
|
Oddělení biotechnologie
-
Ozdravování materiálů od virových chorob
pomocí meristémových kultur a termoterapie a jejich udržování
a množení
-
Diagnostika virů a viroidů chmele technikami
ELISA, molekulární hybridizace a PCR, kontrola zdravotního
stavu ozdravené sadby a vedení evidence pro potřeby uznávacího
řízení ve spolupráci s ÚKZÚZ
-
Shromaždování a udržování genetických
zdrojů chmele technikami in vitro
-
Molekulární testace genetické stability
genotypů rostlin chmele, kontrola šlechtitelského materiálu
a pravosti registrovaných odrůd chmele
-
Molekulární charakterizace genomu chmele,
analýza jednotlivých genů biosyntézy sekundárních metabolitů
-
Studium rezistence chmele k houbovým chorobám
-
Molekulární diagnostika houbových patogenů
a hmyzích škůdců
|
|
|
Výzkumné projekty
- „Molekulární charakterizace a značení chmelového genomu“ (GA503/95/1583,
GAČR, 1996-1998)
- „Molekulární diagnostika chmelových viroidů a jejich eliminace“
(EP0960996299, NAZV MZe, 1996-1999)
- „Molekulární testace genetické stability chmelových genotypů,
kontrola šlechtitelského materiálu a pravosti chmelových
odrůd“ (EP7254, NAZV Mze, 1997-2000)
- „Blokování sekvencí příbuzných chalkon syntáze pomocí antisense
a sense RNA: studium genů podmiňujících biosyntézu hořkých látek
u chmelu (Humulus lupulus L.)“ (GA521/99/1591, GAČR, 1999-2001)
- „Inovace šlechtitelských metod za účelem zkrácení doby tvorby
nových hybridních odrůd“ (EP9357, NAZV MZe, 1999-2001)
- „Molekulární a imunoenzymatická diagnostika vybraných karanténních,
regulovaných a hospodářsky škodlivých patogenů rostlin“ (QC0048,
NAZV MZe, 2000-2004)
- „Komplexní diagnostika a rozšíření viroidních patogenů chmele,
brambor, révy vinné, ovocných a okrasných kultur v ČR“ (QC1183,
NAZV MZe, 2001-2004)
- „Vývoj nových metod pro monitorování diverzity a hodnocení
genových zdrojů a zhodnocení jejich potenciálu“ (QC1336, NAZV
MZe, 2001-2004)
- „Využití biotechnologií při množení a udržování bezvirového
materiálu chmele“ (QD1181, NAZV MZe, 2001-2004)
- „Funkční genomika chmelu (H. lupulus L.) s ohledem na geny
kodeterminující produkci lupulinu (GA521/03/0072, GAČR, 2003-2005)
- „Založení kryobanky pro konzervaci vegetativních vrcholů
bramboru a chmele“ (QF3039, NAZV MZe, 2003-2007)
- „Studium a regulace stresových faktorů chmele“ (MSM 1486434701,
MŠMT ČR, 2004-2010)
- „Studium rezistence ke spále růžovitých u jabloní a hrušní
pomocí molekulární genetiky“ (QF4041, NAZV MZe, 2004-2007)
- „Účinek karanténní houby Verticillium albo-atrum na sortiment
odrůd českého chmele“ (1G46060, NAZV MZe, 2004-2007)
- „Studium výskytu fytopatogenů a jejich genetických variant“
(1QS500510558, AV ČR, 2005-2009)
- „Vývoj genotypů chmele pro biomedicinální a farmaceutické
účely“ (2B06011, MŠMT ČR, 2006-2011)
- „Hodnocení genofondu jabloní (Malus x domestica) molekulárně
genetickými metodami“ (QH72117, NAZV MZe, 2007-2011)
Dotační tituly MZe ČR
- 3.b. Podpora prostorových a technických izolátů množitelského
materiálu ovocných plodin, révy vinné a chmele se zaměřením
na ochranu proti šíření hospodářsky závažných virových chorob
- 3.c. Podpora testování množitelského materiálu s využitím
imunoenzymatických metod a metod PCR
- Národní program konzervace a využívání genetických zdrojů
mikroorganismů a drobných živočichů hospodářského významu
Spolupráce:
Publikace ve vědeckých časopisech:
- Fric, V., Krofta, K., Svoboda, P., Kopecký, J.: The evaluation
of virus-free hops quality after five years growing in Czech
Republic. Rostlinná výroba 43: 307-314, 1997.
- Krofta, K., Nesvadba, V., Patzak, J.: Utilization of wild
hops testation for extention of genetic sources for breeding.
Rostlinná výroba 44: 313-320, 1998.
- Matoušek, J., Junker, V., Vrba, L., Schubert, J., Patzak,
J., Steger, G.: Molecular characterization and genome organization
of 7SL RNA genes from hop (Humulus lupulus L.). Gene 239: 173-183,
1999.
- Matoušek, J., Novák, P., Bříza, J., Patzak, J., Niedermaierová,
H.: Cloning and characterisation of chs-specific DNA and cDNA
sequences from hop (Humulus lupulus L.). Plant Science 162:
1007-1018, 2002.
- Patzak, J.: Characterization of Czech hop (Humulus lupulus
L.) genotypes by molecular methods. Rostlinná Výroba 48: 343-350,
2002.
- Patzak, J., Vejl, P., Skupinová, S., Nesvadba, V.: Identification
of sex in F1 progenies of hop (Humulus lupulus L.) by molecular
marker. Rostlinná Výroba 48: 318-321, 2002.
- Matoušek, J., Novák, P., Patzak, J., Bříza, J., Krofta, K.:
Analysis of true chalcone synthase from Humulus lupulus L. and
biotechnological aspects of medicinal hops. Rostlinná Výroba
48: 7-14, 2002.
- Matoušek, J., Orctová, L., Patzak, J., Svoboda, P., Krofta,
K.: Study of infection and sequence variability of viroids in
CR. Acta Horticulturae 668: 157-164, 2005.
- Matoušek, J., Orctová, L., Patzak, J., Svoboda, P., Ludvíková,
I.: Molecular sampling of hop stunt viroid (HSVd) from grapevines
in hop production areas in the Czech Republic and hop protection.
Plant, Soil and Environment 49: 168-175, 2003.
- Matoušek, J., Patzak, J., Orctová, L., Shubert, J., Vrba,
L., Riesner, D.: The variability of hop latent viroid as induced
upon heat-treatment. Virology 287: 349-358, 2001.
- Matoušek, J., Patzak, J.: A low transmissibility of hop latent
viroid through a generative phase of Humulus lupulus L. Biologia
Plantarum, 43: 145-148, 2000.
- Matoušek, J., Vrba, L., Novák, P., Patzak, J., De Keukeleire,
J., Škopek, J., Heyerick, A, Roldán-Ruiz, I.,De Keukeleire,
D. Cloning and molecular analysis of the regulatory factor HlMyb1
in hops (Humulus lupulus L.) and the potential of hops to produce
bioactive prenylated flavonoids. Journal of Agriculture and
Food Chemistry 53: 4793-4798, 2005.
- Murakami, A., Darby, P., Javorník, B., Pais, M., Seigner,
E., Lutz, A., Svoboda, P.: Molecular phylogeny of wild Hops,
Humulus lupulus L. Heredity 97: 66-74, 2006
- Murakami, A., Darby, P., Javorník, B., Pais, M., Seigner,
E., Lutz, A., Svoboda, P.: Microsatellite DNA analysis of wild
hops, Humulus lupulus L. Genetic Resources and Crop Evolution
53: 1553-1562, 2006.
- Nesvadba, V., Krofta, K., Svoboda, P.: The efficiency of
virus-free Saaz semi-early red-bine hop. Rostlinná výroba 45:
251-254, 1999.
- Novák, P., Patzak, J., Vrba, L., Fussy, Z., Matoušek, J.:
The establishment and screening of hop genomic and cDNA libraries
for genes determining lupulin production. Acta Horticulturae
668: 81-84, 2005.
- Patzak, J., Matoušek, J., Krofta, K., Svoboda, P.: Hop latent
viroid (HLVd)-caused pathogenesis: effects of HLVd infection
on lupulin composition of meristem culture-derived hop (Humulus
lupulus L.). Biologia Plantarum 44: 579-585, 2001.
- Patzak, J., Oriniaková, P., Matoušek, J., Svoboda, P.: Czech
hop characterization using RAPD method and genetic distance
analysis of selected genotypes. Rostlinná výroba 45: 165-172,
1999.
- Patzak, J., Vrba, L. , Matoušek, J.: New STS molecular markers
for assessment of genetic diversity and DNA fingerprinting in
hop (Humulus lupulus L.). Genome 50: 15-25, 2007.
- Patzak, J.: Assessment of somaclonal variability in hop (Humulus
lupulus L.) in vitro meristem cultures and clones by molecular
methods. Euphytica 131: 343-350, 2003.
- Patzak, J.: Comparison of RAPD, STS, ISSR and AFLP molecular
methods used for assessment of genetic diversity in hop (Humulus
lupulus L.). Euphytica 121: 9-18, 2001.
- Patzak, J.: PCR detection of Pseudoperonospora humuli and
Podosphaera macularis in Humulus lupulus. Plant Protection Science
41: 141-149, 2005.
- Patzak, J.: Porovnání metod izolace RNA pro detekci latentního
viroidu chmele (HLVd) pomocí Dot-blot molekulární hybridizace
a RT-PCR u chmele (Humulus lupulus). Biologické listy 68: 219-226,
2003.
- Patzak, J: Utilization of molecular biology methods in hop
breeding and management in CR. Acta Horticulturae 668: 67-74,
2005.
- Petrzik, K., Svoboda, P.: Screening of Apple mosaic virus
in hop cultivars in the Czech republic by reverse transcription
- polymerase chain reaction. Acta Virologica 41: 101-103, 1997.
- Smýkalová, I., Ortová, M., Lipavská, H., Patzak, J.: Efficient
in vitro micropropagation and regeneration of Humulus lupulus
L. on low sugar, starch-Gelrite media. Biologia Plantarum 44:
7-12, 2001.
- Zámečník, J., Svoboda, P., Lynch, P. T. : Dehydration of
hop pollen stored in liquid nitrogen by vitrification. Cryobiology
39: 338,1999.
|
|
|
|
|
|
Kontakty: molekulární analýzy a diagnostika
Ing. Josef Patzak, Ph.D.
tel: +420 415 732 109
e-mail:
j.patzak@telecom.cz
bezvirózní sadba a in vitro kultury
Ing. Petr Svoboda, CSc.
tel: +420 415 732 121
e-mail:
p.svoboda@telecom.cz
|
|
technik ELISA testů a in vitro
kultur
Ing. Ivana Malířová
tel: +420 415 732 149
e-mail:
i.malirova@telecom.cz
technik molekulárních analýz
Bc. Alena Henychová
tel: +420 415 732 109
|
|
|